RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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PTPRB-209ENST00000550857 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-209ENST00000550857 FAM183AA6NL82 134 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRB-209ENST00000550857 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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