RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549815.1

GCN1-206, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-206	ENST00000549815	FEV	Q99581	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	ABHD6	Q9BV23	337 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GCN1-206	ENST00000549815	NDUFA2	O43678	99 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CST1	P01037	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	GRP	P07492	148 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	GSTT1	P30711	240 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CFHR2	P36980	270 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OPRL1	P41146	370 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SLC15A1	P46059	708 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	REEP6	Q96HR9	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TECTB	Q96PL2	329 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TBX15	Q96SF7	602 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	AQP12B	A6NM10	295 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF879	B4DU55	563 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815		H3BN98	237 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TBX1	O43435	398 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ADAM20	O43506	726 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	GYPA	P02724	150 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	HSD11B1	P28845	292 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	MZT1	Q08AG7	82 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OR8B8	Q15620	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CD276	Q5ZPR3	534 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	FAM57B	Q71RH2	274 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SHF	Q7M4L6	423 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SLC25A28	Q96A46	364 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	LRGUK	Q96M69	825 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815		A6NLC8	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	P2RY10	O00398	339 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TMPRSS2	O15393	492 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	APOC1	P02654	83 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	LIPF	P07098	398 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SFTPB	P07988	381 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	GSK3A	P49840	483 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	BPIFB3	P59826	476 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CDK5	Q00535	292 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	GINS1	Q14691	196 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TIGD6	Q17RP2	521 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OTOS	Q8NHW6	89 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	THTPA	Q9BU02	230 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SIRPD	Q9H106	197 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SP140L	Q9H930	580 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815		A0A1B0GW55	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SRRM5	B3KS81	715 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DVL1	O14640	695 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	SELENOF	O60613	162 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	OSM	P13725	252 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GCN1-206	ENST00000549815	AMY2B	P19961	511 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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