RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CHST4Q8NCG5 386 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 MRI1Q9BV20 369 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 Q6ZS92 163 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 RPRMLQ8N4K4 120 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 NEURL2Q9BR09 285 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 LHX6Q9UPM6 363 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RAXQ9Y2V3 346 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CADP27708 2225 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 NR4A2P43354 598 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 PLP2Q04941 152 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 STK11Q15831 433 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 FAM166AQ6J272 317 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IGFL3Q6UXB1 125 aa7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ZNF175Q9Y473 711 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CACNG2Q9Y698 323 aa7.33□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 TMEM235A6NFC5 223 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CENPXA8MT69 81 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 A8MV72 311 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 XRCC3O43542 346 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 VSIG8P0DPA2 414 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IL32P24001 234 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 VEGFCP49767 419 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 GSG1Q2KHT4 349 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 C1QL2Q7Z5L3 287 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 UPRTQ96BW1 309 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CYYR1Q96J86 154 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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CS-215ENST00000549143 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 ANGPTL7O43827 346 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 EDN3P14138 238 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 CCL1P22362 96 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 OR3A2P47893 321 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 MTCP1P56278 107 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa7.32□□□□□ -1.24
CS-215ENST00000549143 UNC119Q13432 240 aa7.32□□□□□ -1.24
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