RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547031.5

KRT8-208, Transcript of keratin 8, human

TSL 2

Gene KRT8, Length 883 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRT8-208	ENST00000547031	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		13.62	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ADAM20	O43506	726 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	GLCE	O94923	617 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	MIDN	Q504T8	468 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.61	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	NDUFA2	O43678	99 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	E2F6	O75461	281 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ANOS1	P23352	680 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PSMB10	P40306	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	FGF12	P61328	243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.6	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ACOT8	O14734	319 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	HMGN1	P05114	100 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	GNAL	P38405	381 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	FAM3A	P98173	230 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	GINS1	Q14691	196 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	SNCB	Q16143	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	TEX12	Q9BXU0	123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.59	□□□□□ -0.23
KRT8-208	ENST00000547031	PLAT	P00750	562 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	GYPA	P02724	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	LIPF	P07098	398 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.58	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	C22orf46	C9J442	243 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	CLDN34	H7C241	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	GYG2	O15488	501 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	TIPRL	O75663	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	LYN	P07948	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	OSM	P13725	252 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	OPRL1	P41146	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	GSK3A	P49840	483 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	BPIFB3	P59826	476 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	MICU1	Q9BPX6	476 aa		13.57	□□□□□ -0.24
KRT8-208	ENST00000547031	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24

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