RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537007.5

MRPL48-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L48, human

TSL 3

Gene MRPL48, Length 287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL48-208	ENST00000537007	SIGLEC5	O15389	551 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	FGF17	O60258	216 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	TSC22D2	O75157	780 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ANXA9	O76027	345 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	MBD3	O95983	291 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	CLPTM1	O96005	669 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	IGF2	P01344	180 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	GSTA1	P08263	222 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	HCK	P08631	526 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	CECR9	P0C854	216 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	C4BPB	P20851	252 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	NT5E	P21589	574 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	UQCRC2	P22695	453 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ANOS1	P23352	680 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	SHC1	P29353	583 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	CRYBB2	P43320	205 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	LIM2	P55344	173 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	XG	P55808	180 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	PRPS1	P60891	318 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	CBX1	P83916	185 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	STX5	Q13190	355 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	SELPLG	Q14242	412 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ITIH4	Q14624	930 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	2.03	□□□□□ -2.08	4e-11	■■■■■ 43.4
MRPL48-208	ENST00000537007	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	HAGH	Q16775	308 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	GTDC1	Q4AE62	458 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	BOLA3	Q53S33	107 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	TTMP	Q5BVD1	217 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007		Q6ZRG5	221 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	RANBP3L	Q86VV4	465 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	LRP11	Q86VZ4	500 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	NEURL3	Q96EH8	262 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	PANX2	Q96RD6	677 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	USP28	Q96RU2	1077 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	PITX2	Q99697	317 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	TSG101	Q99816	390 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF649	Q9BS31	505 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	TRIM15	Q9C019	465 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZFP57	Q9NU63	452 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	RDH8	Q9NYR8	311 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	FZR1	Q9UM11	496 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	B9D1	Q9UPM9	204 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	PDE10A	Q9Y233	779 aa		2.03	□□□□□ -2.08
MRPL48-208	ENST00000537007	AGRN	O00468	2067 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	SURF4	O15260	269 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	CFLAR	O15519	480 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	PCDH7	O60245	1069 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	BRI3	O95415	125 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	AGT	P01019	485 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IGHV1-69	P01742	117 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	MT-ND1	P03886	318 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	CALB1	P05937	261 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	UQCRB	P14927	111 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	TSPAN8	P19075	237 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	PAX7	P23759	505 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IMPA1	P29218	277 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	HSD17B2	P37059	387 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	RGS4	P49798	205 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	PPT1	P50897	306 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	CARD18	P57730	90 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	TBPL1	P62380	186 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	LY6E	Q16553	131 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	2.02	□□□□□ -2.09
MRPL48-208	ENST00000537007	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		2.02	□□□□□ -2.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms