RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	TEAD3	Q99594	435 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LRP12	Q9Y561	859 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	WNT2	P09544	360 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF12	P17014	697 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	EPHA2	P29317	976 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	EFNB1	P98172	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	LIPN	Q5VXI9	398 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FTMT	Q8N4E7	242 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM163	Q8TC26	289 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CIB1	Q99828	191 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	RNF7	Q9UBF6	113 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OPN4	Q9UHM6	478 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF254	O75437	659 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF205	O95201	554 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	EPHA1	P21709	976 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	DCTD	P32321	178 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	GSK3A	P49840	483 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ACTR3	P61158	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	PAX2	Q02962	417 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ROM1	Q03395	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KCNJ8	Q15842	424 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	KRT77	Q7Z794	578 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	GID4	Q8IVV7	300 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	NANP	Q8TBE9	248 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ITFG2	Q969R8	447 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MNT	Q99583	582 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	ABCB9	Q9NP78	766 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	BRD7	Q9NPI1	651 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	MMP26	Q9NRE1	261 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM28-208	ENST00000495327		A0A0U1RQV5	110 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ACOD1	A6NK06	481 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327		M0R129	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PHYH	O14832	338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MRPL3	P09001	348 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ADRA2C	P18825	462 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PSMB10	P40306	273 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	GNB2	P62879	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF154	Q13106	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	USP43	Q70EL4	1123 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR8S1	Q8NH09	359 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	OR8B4	Q96RC9	309 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MRO	Q9BYG7	248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	FAM206A	Q9NX38	181 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	COPS3	Q9UNS2	423 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327		A6NLC8	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PRR32	B1ATL7	298 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	LGALS8	O00214	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM28-208	ENST00000495327	ACKR3	P25106	362 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms