RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494037.1

TSPAN7-208, Transcript of tetraspanin 7, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN7, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7-208ENST00000494037 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 USP43Q70EL4 1123 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PARP8Q8N3A8 854 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SGK3Q96BR1 496 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PGAM5Q96HS1 289 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PLEKHA8Q96JA3 519 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8B2Q96RD0 313 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RNF7Q9UBF6 113 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CTSZQ9UBR2 303 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MIOXQ9UGB7 285 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 AUP1Q9Y679 476 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.91□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 A6NLC8 198 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 LGALS8O00214 317 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PRKYO43930 277 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FCN3O75636 299 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 APOC1P02654 83 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GRPP07492 148 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ALOX5APP20292 161 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ACKR3P25106 362 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 EPHA2P29317 976 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 GSK3AP49840 483 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 HCCSP53701 268 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CRISP1P54107 249 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CSNK2BP67870 215 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PAX8Q06710 450 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8B8Q15620 311 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SNAPC1Q16533 368 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SLC35D3Q5M8T2 416 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF454Q8N9F8 522 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 THEM6Q8WUY1 208 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 NRBF2Q96F24 287 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 LYZL4Q96KX0 146 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MRI1Q9BV20 369 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TTTY10Q9BZA0 68 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 OR10A2Q9H208 303 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 CLN8Q9UBY8 286 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 ZNF69Q9UC07 566 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 NUP50Q9UKX7 468 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 COPS3Q9UNS2 423 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 LRP12Q9Y561 859 aa6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TSPAN7-208ENST00000494037 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 A0A1B0GW55 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 OOEPA6NGQ2 149 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PSMD9O00233 223 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 PHYHO14832 338 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 GYPAP02724 150 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 CPT2P23786 658 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 DDOSTP39656 456 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ESRRGP62508 458 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ACTG1P63261 375 aa6.89□□□□□ -1.31
TSPAN7-208ENST00000494037 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms