RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC36A2Q495M3 483 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MESTQ5EB52 335 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 UBQLN3Q9H347 655 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGLEC7Q9Y286 467 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EP13 123 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC42EP2O14613 210 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FGF16O43320 207 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB7O75200 414 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 YIF1AO95070 293 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SOX14O95416 240 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IL5P05113 134 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HKR1P10072 659 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF17P17021 662 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ACKR3P25106 362 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SHC1P29353 583 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GIPRP48546 466 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PITPNBP48739 271 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GINS1Q14691 196 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HMGN3Q15651 99 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF74Q16587 644 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PRAMEF20Q5VT98 475 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MTFR2Q6P444 385 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SMARCD3Q6STE5 483 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZTK2 550 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52D1Q9H346 318 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP26Q9NRE1 261 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LRFN1Q9P244 771 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C17orf51A8MQB3 221 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NKX2-8O15522 239 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AHSA1O95433 338 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GALP22466 123 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CPT2P23786 658 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MPZP25189 248 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC6A6P31641 620 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 F2RL1P55085 397 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CDH11P55287 796 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PRPS1P60891 318 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 VAMP2P63027 116 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EGR4Q05215 589 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXF1Q12946 379 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DOC2BQ14184 412 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM189A2Q15884 450 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PGGHGQ32M88 737 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LEMD1Q68G75 181 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR73Q6P4I2 378 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T33Q8NG76 320 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF524Q96C55 264 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DDIT4LQ96D03 193 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TSSK6Q9BXA6 273 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MFFQ9GZY8 342 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ACKR4Q9NPB9 350 aa6.42□□□□□ -1.38
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