RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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HOXB3-211ENST00000490677 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 OOEPA6NGQ2 149 aa23.08■■□□□ 1.29
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HOXB3-211ENST00000490677 FGF12P61328 243 aa23.08■■□□□ 1.29
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HOXB3-211ENST00000490677 GINS1Q14691 196 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
HOXB3-211ENST00000490677 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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HOXB3-211ENST00000490677 SLC9A3R2Q15599 337 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 TIGD6Q17RP2 521 aa23.07■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 TEX36Q5VZQ5 186 aa23.07■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 OR52H1Q8NGJ2 320 aa23.06■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa23.05■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.05■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 A6NLC8 198 aa23.04■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 TBX15Q96SF7 602 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 TLNRD1Q9H1K6 362 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM36Q9NQ86 728 aa23.04■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 ERVK-18Q9QC07 812 aa23.04■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 LYNP07948 512 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 DUX4L2P0CJ85 424 aa23.03■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 DUX4L4P0CJ87 422 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 DUX4L5P0CJ88 424 aa23.03■■□□□ 1.28
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HOXB3-211ENST00000490677 DUX4L7P0CJ90 424 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 PAICSP22234 425 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 ACKR3P25106 362 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 MTNR1AP48039 350 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 MZT1Q08AG7 82 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 POU4F2Q12837 409 aa23.03■■□□□ 1.28
HOXB3-211ENST00000490677 FOXL1Q12952 345 aa23.03■■□□□ 1.28
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