RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	AMELY	Q99218	206 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GNGT2	O14610	69 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GRP	P07492	148 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	HKR1	P10072	659 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	POU1F1	P28069	291 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OPRL1	P41146	370 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	MTNR1A	P48039	350 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FGF12	P61328	243 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GINS1	Q14691	196 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR8B8	Q15620	311 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SP140L	Q9H930	580 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ADAM20	O43506	726 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	WDR86	Q86TI4	376 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR8S1	Q8NH09	359 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR10A2	Q9H208	303 aa		13.12	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CLDN34	H7C241	214 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	NDUFA2	O43678	99 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SELENOF	O60613	162 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	E2F6	O75461	281 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	LHB	P01229	141 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GYPA	P02724	150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	EGR1	P18146	543 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FOXL1	Q12952	345 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CD276	Q5ZPR3	534 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OTOS	Q8NHW6	89 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.11	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PRODH	O43272	600 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	HMGN1	P05114	100 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	LYN	P07948	512 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OSM	P13725	252 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CFHR2	P36980	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GSK3A	P49840	483 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CDK5	Q00535	292 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FLOT2	Q14254	428 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR157	Q5UAW9	335 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	SPATA24	Q86W54	205 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.1	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GYG2	O15488	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FKBP6	O75344	327 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	FCN3	O75636	299 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	TIPRL	O75663	272 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	LIPF	P07098	398 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	ANXA8	P13928	327 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	PRKACG	P22612	351 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-223	ENST00000489571	GNAL	P38405	381 aa		13.09	□□□□□ -0.31

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