RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.9□□□□□ -0.02
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.9□□□□□ -0.02
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNK15Q9H427 330 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADIRFQ15847 76 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf79Q96F83 325 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GABRG3Q99928 467 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPA3Q9H6K4 179 aa14.87□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAB5CP51148 216 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ST3GAL2Q16842 350 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCN15Q6UWW0 184 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAP18Q8IXM2 172 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDFY2Q96P53 400 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIB1Q96RU8 372 aa14.86□□□□□ -0.03
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
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