RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 FADS6Q8N9I5 356 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR10K1Q8NGX5 313 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 THAP6Q8TBB0 222 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PGAM5Q96HS1 289 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 MICU1Q9BPX6 476 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A32Q9H2D1 315 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DMDP11532 3685 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 F5H5K5 113 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 BCL2L11O43521 198 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 WDPCPO95876 746 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 SLC6A9P48067 706 aa14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 HIST3H3Q16695 136 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 TMPPEQ6ZT21 453 aa14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.94□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 RNF222A6NCQ9 220 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 G3V3Y1 287 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 RAD51DO75771 328 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 TBPP20226 339 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ADH6P28332 368 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 TMEM50BP56557 158 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ARFRP1Q13795 201 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PCOLCEQ15113 449 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 HLA-BQ31612 363 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 HOGA1Q86XE5 327 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 TERB2Q8NHR7 220 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 FBXW5Q969U6 566 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.93□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 MBD2Q9UBB5 411 aa14.93□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 ELP2Q6IA86 826 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 SPERTQ8NA61 448 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 RASL12Q9NYN1 266 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ONECUT2O95948 504 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PI3P19957 117 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 SERPINF1P36955 418 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 HLA-CQ95604 372 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 A0A1B0GW55 424 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR5H15A6NDH6 313 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUX4L2P0CJ85 424 aa14.91□□□□□ -0.02
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ACTB-207ENST00000462494 DUX4L5P0CJ88 424 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUX4L6P0CJ89 424 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUX4L7P0CJ90 424 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 MSR1P21757 451 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 CCL1P22362 96 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 PRKACBP22694 351 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 LYZL4Q96KX0 146 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 OR10A2Q9H208 303 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 DUX4Q9UBX2 424 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-207ENST00000462494 CCL3P10147 92 aa14.9□□□□□ -0.02
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