RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 OR8B3Q8NGG8 313 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 PGAM5Q96HS1 289 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 OR8B2Q96RD0 313 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 SLC22A4Q9H015 551 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 TOR3AQ9H497 397 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 ESM1Q9NQ30 184 aa11.55□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 MIOXQ9UGB7 285 aa11.55□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa11.54□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 OR10A2Q9H208 303 aa11.54□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF69Q9UC07 566 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 COPS3Q9UNS2 423 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 LRP12Q9Y561 859 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 A0A0A6YYJ9 748 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GW55 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 C22orf46C9J442 243 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 PRKYO43930 277 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L2P0CJ85 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L3P0CJ86 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L4P0CJ87 422 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L5P0CJ88 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L6P0CJ89 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4L7P0CJ90 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 ACTG1P63261 375 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 OR8B8Q15620 311 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 C1orf146Q5VVC0 180 aa11.53□□□□□ -0.56
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PRAME-209ENST00000439106 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 ZDHHC22Q8N966 263 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 OR8B12Q8NGG6 310 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 SEH1LQ96EE3 360 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 DUX4Q9UBX2 424 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 CLN8Q9UBY8 286 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-209ENST00000439106 TRAV40A0A0B4J280 105 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LGALS8O00214 317 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FCN3O75636 299 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 APOC1P02654 83 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 GYPAP02724 150 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PSMB10P40306 273 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
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PRAME-209ENST00000439106 ATP6AP1Q15904 470 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 DMRTC1Q5HYR2 192 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 KRT77Q7Z794 578 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FGFRL1Q8N441 504 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LRRC29Q8WV35 223 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 RAB40AQ8WXH6 277 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 LRTOMTQ8WZ04 291 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NRBF2Q96F24 287 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 TECTBQ96PL2 329 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-209ENST00000439106 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.52□□□□□ -0.57
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