RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 FREM2Q5SZK8 3169 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 BTBD17A6NE02 478 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSM4P0C7M7 580 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 IL10RAQ13651 578 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PLA1AQ53H76 456 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PMS2CLQ68D20 193 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RTN4RL2Q86UN3 420 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 BEST3Q8N1M1 668 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM71CQ8NEG0 241 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ST8SIA1Q92185 356 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2M2Q96R28 347 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CA10Q9NS85 328 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ESPL1Q14674 2120 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR2M5A3KFT3 312 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 LIPT2A6NK58 231 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 AANATQ16613 207 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 GSG1Q2KHT4 349 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CREB3L2Q70SY1 520 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 FJX1Q86VR8 437 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR10Z1Q8NGY1 313 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PIGCQ92535 297 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 POTEKPQ9BYX7 375 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 K7EPK0 472 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 AGPAT2O15120 278 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 C1QBP02746 253 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ABHD17BQ5VST6 288 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM198BQ6UWH4 519 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 NLRC3Q7RTR2 1065 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RNF144BQ7Z419 303 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR11H4Q8NGC9 324 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5T2Q8NGG2 359 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ASB10Q8WXI3 467 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 NICN1Q9BSH3 213 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PARPBPQ9NWS1 579 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 HTR5AP47898 357 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF84P51523 738 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 C3P1Q6ZMU1 363 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 GALNT16Q8N428 558 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 MFRPQ9BY79 579 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS10P5Q9NQ39 176 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1B0GV50 99 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM82A0PJX8 343 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 EFNA2O43921 213 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 SFRP5Q5T4F7 317 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 AAED1Q7RTV5 226 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF561Q8N587 486 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 LRRC75AQ8NAA5 344 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 HES7Q9BYE0 225 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PR80 420 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C76A6NM76 312 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 SOX15O60248 233 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OPRM1P35372 400 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR3A4PP47883 348 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 FNDC7Q5VTL7 733 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ADAM5Q6NVV9 412 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 GABRG1Q8N1C3 465 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 MFSD8Q8NHS3 518 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CYYR1Q96J86 154 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 NPAP1Q9NZP6 1156 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 GLSO94925 669 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CD34P28906 385 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 KMT5CQ86Y97 462 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR1M1Q8NGA1 313 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A0G2JMM0 328 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PPB8 328 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 A0A1W2PRS3 328 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 PCNX2A6NKB5 2137 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 KIR3DP1A8MWS1 328 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 MISPQ8IVT2 679 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF680Q8NEM1 530 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR11G2Q8NGC1 345 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 OR14K1Q8NGZ2 314 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFAND1Q8TCF1 268 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 STRADBQ9C0K7 418 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 UCK1Q9HA47 277 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CRLF2Q9HC73 371 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 DOCK10Q96BY6 2186 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-210ENST00000437078 CADP27708 2225 aa12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms