RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.63■■□□□ 1.21
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LMO1-202ENST00000428101 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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LMO1-202ENST00000428101 PGAM5Q96HS1 289 aa22.56■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 TBX15Q96SF7 602 aa22.56■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 PCGF1Q9BSM1 259 aa22.56■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 KAAG1Q9UBP8 84 aa22.56■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 HMGN1P05114 100 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 LYNP07948 512 aa22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
LMO1-202ENST00000428101 BPIFB3P59826 476 aa22.55■■□□□ 1.2
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