RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 VNN3Q9NY84 501 aa17.4■□□□□ 0.38
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LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC5A6NEK1 342 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RIIAD1A6NNX1 92 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 WIPF1O43516 503 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TIPRLO75663 272 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TOX4O94842 621 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ECDO95905 644 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 GRPP07492 148 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 PRSS45Q7RTY3 260 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 FAM90A1Q86YD7 464 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR52H1Q8NGJ2 320 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC16Q969W1 377 aa17.39■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 WDFY2Q96P53 400 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TBX15Q96SF7 602 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 PCGF1Q9BSM1 259 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 U3KQV3 271 aa17.39■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 A6NLC8 198 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 B2RBV5 119 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 SFTPBP07988 381 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 HSD11B1P28845 292 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RPL15P61313 204 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD1Q15116 288 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TIGD6Q17RP2 521 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 SPATC1Q76KD6 591 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR8S1Q8NH09 359 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 REEP6Q96HR9 211 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 DMRTB1Q96MA1 342 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 INTS14Q96SY0 518 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 SIRPDQ9H106 197 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 POMT1Q9Y6A1 747 aa17.38■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa17.37■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 MDKP21741 143 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 SHFQ7M4L6 423 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 DPY19L4Q7Z388 723 aa17.37■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 C11orf53Q8IXP5 236 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR10G2Q8NGC3 310 aa17.37■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ABHD6Q9BV23 337 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 TLNRD1Q9H1K6 362 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RGCCQ9H4X1 137 aa17.37■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 FCN3O75636 299 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 GLCEO94923 617 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RAP2AP10114 183 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 GSTT1P30711 240 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OPRL1P41146 370 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 MS4A2Q01362 244 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 FTMTQ8N4E7 242 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR1M1Q8NGA1 313 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR6N2Q8NGY6 317 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ASB9Q96DX5 294 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 NSL1Q96IY1 281 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 ACOXLQ9NUZ1 547 aa17.36■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa17.36■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 DVL1O14640 695 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA7O95182 113 aa17.35■□□□□ 0.37
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 MICBQ29980 383 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 KLHL12Q53G59 568 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 WDR82Q6UXN9 313 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 BTN2A1Q7KYR7 527 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR4F5Q8NH21 305 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 OR10A2Q9H208 303 aa17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
LIMS1-208ENST00000428064 KPTNQ9Y664 436 aa17.35■□□□□ 0.37
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