RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CSNK2BP67870 215 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 SPNS3Q6ZMD2 512 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 AHSA2Q719I0 299 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 EGFL6Q8IUX8 553 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS35Q8N3Z0 413 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 Q96MF0 132 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 GPR84Q9NQS5 396 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 HLA-DPB1P04440 258 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CD55P08174 381 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 ACKR3P25106 362 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 WDR38Q5JTN6 314 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 OR10AD1Q8NGE0 317 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 UBASH3BQ8TF42 649 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 DECR2Q9NUI1 292 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 UBAP1Q9NZ09 502 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC2DQ9UHP7 191 aa25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 LYNX1G3V0Z9 82 aa25.55■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 LYNX1P0DP58 116 aa25.55■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CA6P23280 308 aa25.55■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF540Q8NDQ6 660 aa25.55■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 OR2G2Q8NGZ5 317 aa25.55■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 COL8A2P25067 703 aa25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 KIR3DL2P43630 455 aa25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 FDX2Q6P4F2 183 aa25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 SAP30LQ9HAJ7 183 aa25.54■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1B0GTI1 187 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 MYL12AP19105 171 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 ODF4Q2M2E3 257 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 COMMD2Q86X83 199 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF786Q8N393 782 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 FRRS1LQ9P0K9 344 aa25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 P2RY10O00398 339 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 OR2G6Q5TZ20 316 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC2AQ6UVW9 174 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 STX19Q8N4C7 294 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 PLPP7Q8NBV4 271 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 RDH5Q92781 318 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 YIPF5Q969M3 257 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 IL19Q9UHD0 177 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 PTGES3LE9PB15 166 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 E9PI62 339 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 F5H5P2 479 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 HTR1AP08908 422 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 TNFSF4P23510 183 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 MED21Q13503 144 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 FAM168AQ92567 244 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 OR2V2Q96R30 315 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 EGLN1Q9GZT9 426 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 SLC22A4Q9H015 551 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 SCN3BQ9NY72 215 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa25.52■■□□□ 1.68
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CDC14BO60729 498 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC159P0C7I6 412 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CRYBB2P43320 205 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 PDLIM4P50479 330 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 DSCR9P59020 149 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CARTPTQ16568 116 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 KLHL36Q8N4N3 616 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 C10orf105Q8TEF2 133 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 SGCDQ92629 289 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa25.51■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM64A6NGJ6 449 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM64BA6NI03 449 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CSF3P09919 207 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 MAP2K3P46734 347 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CCR9P51686 369 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 ITLN1Q8WWA0 313 aa25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 TANC2Q9HCD6 1990 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 GMDSO60547 372 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 RP2O75695 350 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 DHRS3O75911 302 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CDK1P06493 297 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 ATP6V1B1P15313 513 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 CCL1P22362 96 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 SLC35A2P78381 396 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 OR8G1Q15617 311 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 Q6ZSR3 168 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 RDH10Q8IZV5 341 aa25.49■■□□□ 1.67
PKDCC-202ENST00000401498 MEGF10Q96KG7 1140 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms