RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB37Q5TC79 503 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SLC22A25Q6T423 547 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PARP16Q8N5Y8 322 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PLPP7Q8NBV4 271 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01560Q8TB33 94 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SLC25A40Q8TBP6 338 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR2J1Q9GZK6 312 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TAS2R4Q9NYW5 299 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PTTG2Q9NZH5 202 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 KCNN3Q9UGI6 736 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HCFC1P51610 2035 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 A6NIN4 97 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ABCD4O14678 606 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 LMX1BO60663 402 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 THBDP07204 575 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CD3EP07766 207 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HCKP08631 526 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FAHP16930 419 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RPS19P39019 145 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CDSNQ15517 529 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CEP78Q5JTW2 689 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GLT8D1Q68CQ7 371 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 VHLLQ6RSH7 139 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NKAIN3Q8N8D7 197 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PIGCQ92535 297 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 AP3S1Q92572 193 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ORAI1Q96D31 301 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CMBLQ96DG6 245 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DACH2Q96NX9 599 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TECTBQ96PL2 329 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SOX7Q9BT81 388 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM30A4D0T7 59 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD61A6NGH8 418 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PIN1P1O15428 100 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SULT1B1O43704 296 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NRASP01111 189 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 EPXP11678 715 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 RAC2P15153 192 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ANOS1P23352 680 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 BDKRB2P30411 391 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 KIR2DL3P43628 341 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 BSPH1Q075Z2 132 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR8B8Q15620 311 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 BEX5Q5H9J7 111 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CLVS2Q5SYC1 327 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FBXW12Q6X9E4 464 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZSR3 168 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR1M1Q8NGA1 313 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR13C9Q8NGT0 318 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PLPPR2Q96GM1 343 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 POFUT1Q9H488 388 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PLGRKTQ9HBL7 147 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM138Q9NPI0 162 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 V9GY05 133 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MYO7BQ6PIF6 2116 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DPRXA6NFQ7 191 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CD300LBA8K4G0 201 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NOTOA8MTQ0 251 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ATF1P18846 271 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PRKACBP22694 351 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 GLRXP35754 106 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 FABP6P51161 128 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PRSS12P56730 875 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 ERVS71-1P61550 626 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 TFF3Q07654 80 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 SPOCK1Q08629 439 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 MOGQ16653 247 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 NCMAPQ5T1S8 102 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 IDNKQ5T6J7 187 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 DDI2Q5TDH0 399 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 PLCXD3Q63HM9 321 aa10.48□□□□□ -0.73
PTPRK-201ENST00000368202 OR2T2Q6IF00 324 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms