RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 CCR7P32248 378 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 AHRP35869 848 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN2CP42773 168 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RARRES1P49788 294 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TPMTP51580 245 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT6P53370 316 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00310P59036 64 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF846Q147U1 533 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TIGITQ495A1 244 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GLYATQ6IB77 296 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF613Q6PF04 617 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM64Q6YI46 380 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF841Q6ZN19 808 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SSX8Q7RTT4 187 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 SPRED1Q7Z699 444 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR10H4Q8NGA5 316 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR11H4Q8NGC9 324 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR56A4Q8NGH8 313 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR6X1Q8NH79 312 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO17Q96EF6 278 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC115Q96NT0 180 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 OR5M11Q96RB7 305 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TM6SF2Q9BZW4 377 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GLIPR2Q9H4G4 154 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 GAREM1Q9H706 876 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 UBTD1Q9HAC8 227 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 MYOZ2Q9NPC6 264 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 ACP6Q9NPH0 428 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 RAB26Q9ULW5 256 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 FADS3Q9Y5Q0 445 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 NINQ8N4C6 2090 aa2.15□□□□□ -2.06
CCSAP-202ENST00000366686 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1B0GTL3 188 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM72A0PK05 275 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GAGE12JA6NER3 117 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FAM159BA6NKW6 160 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 B8ZZF3 427 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CXCR6O00574 342 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GPR171O14626 319 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF432O94892 652 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GJB5O95377 273 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM50AO95807 157 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACTL6AO96019 429 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IRF2P14316 349 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PTNP21246 168 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AQP1P29972 269 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR1E1P30953 314 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TNFSF9P41273 254 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GPR1P46091 355 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR1E2P47887 323 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RAB13P51153 203 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RIDAP52758 137 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ELLP55199 621 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ARG2P78540 354 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UBE2NLQ5JXB2 153 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ENPP6Q6UWR7 440 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM17Q86X19 198 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 WDSUB1Q8N9V3 476 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR5M1Q8NGP8 315 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR2G2Q8NGZ5 317 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4C6Q8NH72 309 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BLNKQ8WV28 456 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HTR3CQ8WXA8 447 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SGTBQ96EQ0 304 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF382Q96SR6 550 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DCSTAMPQ9H295 470 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF385DQ9H6B1 395 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 REEP1Q9H902 201 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 EDA2RQ9HAV5 297 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms