RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 BABAM2Q9NXR7 383 aa12.51□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 METTL15A6NJ78 407 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 C17orf100A8MU93 164 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 DBHP09172 617 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF81P51508 661 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 HCCSP53701 268 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MALLQ13021 153 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TEX30Q5JUR7 227 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 LYPD4Q6UWN0 246 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CLEC9AQ6UXN8 241 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 UBASH3BQ8TF42 649 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CENPMQ9NSP4 180 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SSR3Q9UNL2 185 aa12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF878C9JN71 531 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 M0R135 149 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MPV17P39210 176 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 RPS27P42677 84 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 LINC00299Q6ZSB3 139 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM203Q969S6 136 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SLAMF6Q96DU3 332 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF799Q96GE5 643 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MAP6Q96JE9 813 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 C4orf36Q96KX1 117 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 DIRC2Q96SL1 478 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 COPS3Q9UNS2 423 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 STARD10Q9Y365 291 aa12.49□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 E9PI62 339 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 APOC1P02654 83 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 LCATP04180 440 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TNFSF4P23510 183 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 HSD11B1P28845 292 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 OPRL1P41146 370 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 BMXP51813 675 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 GRB2P62993 217 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 FABP5Q01469 135 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 GPR50Q13585 617 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PCK2Q16822 640 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CDONQ4KMG0 1287 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 FAM209AQ5JX71 171 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SLC16A9Q7RTY1 509 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 DPY19L4Q7Z388 723 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TIGD4Q8IY51 512 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 RDH5Q92781 318 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CMBLQ96DG6 245 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SP140LQ9H930 580 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM36Q9NQ86 728 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PTTG3PQ9NZH4 202 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 A3GALT2U3KPV4 340 aa12.48□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 J3QLW9 94 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ACSM4P0C7M7 580 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 RAC2P15153 192 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SELEP16581 610 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF19P17023 458 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CELP19835 753 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ACHEP22303 614 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 OR12D2P58182 307 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ACTA2P62736 377 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ACTG2P63267 376 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 CCL8P80075 99 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PSG7Q13046 419 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 DRAM2Q6UX65 266 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SYS1Q8N2H4 156 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MCFD2Q8NI22 146 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 KCNJ15Q99712 375 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MARCH7Q9H992 704 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SAP30LQ9HAJ7 183 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PLGRKTQ9HBL7 147 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 AKIP1Q9NQ31 210 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 VPS13CQ709C8 3753 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 ACANP16112 2415 aa12.47□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 SPRY3O43610 288 aa12.46□□□□□ -0.41
BRMS1-201ENST00000359957 KITLGP21583 273 aa12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms