RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 TCL1AP56279 114 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 METRNLQ641Q3 311 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR4S1Q8NGB4 309 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ARSGQ96EG1 525 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 VENTXO95231 258 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FSTP19883 344 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PTGER4P35408 488 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SYT9Q86SS6 491 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF429Q86V71 674 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 GPR78Q96P69 363 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OPALINQ96PE5 141 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 VN1R3Q9BXE9 311 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GV72 72 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GVT2 93 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CHEK1O14757 476 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PRKACGP22612 351 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RPEL1Q2QD12 228 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 VAX2Q9UIW0 290 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PQD3 144 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CTSVO60911 334 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 NME1P15531 152 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM25Q86YD3 366 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PRR22Q8IZ63 422 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM178AQ8NBL3 297 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 CORTO00230 105 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF534Q76KX8 674 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 OXGR1Q96P68 337 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CHST8Q9H2A9 424 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF226Q9NYT6 803 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 RABAC1Q9UI14 185 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 SUSD5O60279 629 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 AREGP15514 252 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 PPICP45877 212 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 CEBPEQ15744 281 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRD-201ENST00000355233 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SPAG17Q6Q759 2223 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1W2PN81 502 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRD-201ENST00000355233 SLC5A10A0PJK1 596 aa4.45□□□□□ -1.7
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