RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308641.5

APOBEC4-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic polypeptide like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC4, Length 2,650 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4-201ENST00000308641 SYS1Q8N2H4 156 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SDSLQ96GA7 329 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 MEMO1Q9Y316 297 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TMED7Q9Y3B3 224 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 YPEL1O60688 119 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 EPPINO95925 133 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CD160O95971 181 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 AKR1C4P17516 323 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CD22P20273 847 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SLC16A1P53985 500 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ID2Q02363 134 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 NEURL3Q96EH8 262 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 MS4A10Q96PG2 267 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 YPEL2Q96QA6 119 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SMIM14Q96QK8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 FBXL17Q9UF56 701 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 MSRAQ9UJ68 235 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 HSF4Q9ULV5 492 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 INSL6Q9Y581 213 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 GREB1Q4ZG55 1949 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.29□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TSPAN11A1L157 253 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 AQP7P3A6NL99 342 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 NTN1O95631 604 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CYB5AP00167 134 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 LIPFP07098 398 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 IL9P15248 144 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 GRK4P32298 578 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RIPPLY3P57055 190 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TAS2R41P59536 307 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 HLA-DRB3P79483 266 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RAB32Q13637 225 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PRSS53Q2L4Q9 553 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TMPRSS12Q86WS5 348 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RFLNBQ8N5W9 214 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 EXD3Q8N9H8 876 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TMEM239Q8WW34 195 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 GPR146Q96CH1 333 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 LOXL4Q96JB6 756 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 CD180Q99467 661 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RAB18Q9NP72 206 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SLC7A7Q9UM01 511 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 HMGN4O00479 90 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 SYNGR4O95473 234 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PRH1P02810 166 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ZNF28P17035 718 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 PTNP21246 168 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 FCGR2CP31995 323 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RHOGP84095 191 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 RBPJQ06330 500 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 IL24Q13007 206 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 NFATC4Q14934 902 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 FAM219AQ8IW50 185 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 APCDD1LQ8NCL9 501 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 OR51A7Q8NH64 312 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 VAMP8Q9BV40 100 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ZBP1Q9H171 429 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 FUT9Q9Y231 359 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 HS3ST4Q9Y661 456 aa7.28□□□□□ -1.24
APOBEC4-201ENST00000308641 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms