RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PP11 408 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PPC4 97 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPIPB13A6NJU9 1138 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 NPIPB4C9JG80 1138 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ZNF20P17024 532 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 BIDP55957 195 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 ACTBL2Q562R1 376 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DMBX1Q8NFW5 382 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 LMX1AQ8TE12 382 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SMIM8Q96KF7 97 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CHST11Q9NPF2 352 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 FARS2O95363 451 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 HEXAP06865 529 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 FPR2P25090 351 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CBX5P45973 191 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 GPR85P60893 370 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 PDZK1IP1Q13113 114 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 RAB32Q13637 225 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 C5orf34Q96MH7 638 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 SLC26A1Q9H2B4 701 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CLEC1BQ9P126 229 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 CD207Q9UJ71 328 aa13.21□□□□□ -0.29
SYP-201ENST00000263233 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ANOS1P23352 680 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 KCNJ3P48549 501 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 CAV2P51636 162 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LANCL3Q6ZV70 420 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 POC1AQ8NBT0 407 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR13G1Q8NGZ3 307 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 MVB12AQ96EY5 273 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 KLHL13Q9P2N7 655 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 IL15RAQ13261 267 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 AVPI1Q5T686 147 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 AADACL3Q5VUY0 350 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LHFPL1Q86WI0 220 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR5H2Q8NGV7 314 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ST8SIA1Q92185 356 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 C2orf50Q96LR7 162 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 TMEM59Q9BXS4 323 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 VN1R1Q9GZP7 353 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 IFT22Q9H7X7 185 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SUSD2Q9UGT4 822 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 VDAC3Q9Y277 283 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LHFPL6Q9Y693 200 aa13.2□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SEC16AO15027 2179 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 MFNGO00587 321 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 IGLV3-19P01714 112 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SLC2A1P11166 492 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LAP3P28838 519 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LPAR6P43657 344 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZFP82Q8N141 532 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR1L3Q8NH93 324 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF319Q9P2F9 582 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 WIF1Q9Y5W5 379 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 LRP3O75074 770 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RPS2P15880 293 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 FOXL2P58012 376 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 COMMD2Q86X83 199 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 GKN2Q86XP6 184 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 OR8B12Q8NGG6 310 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SERINC1Q9NRX5 453 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 B3GAT1Q9P2W7 334 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 DNAJB11Q9UBS4 358 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ATPIF1Q9UII2 106 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 GON4LQ3T8J9 2241 aa13.19□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa13.18□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 H3BML4 177 aa13.18□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 HTR3BO95264 441 aa13.18□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 SFTA3P0C7M3 94 aa13.18□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 ZNF17P17021 662 aa13.18□□□□□ -0.3
SYP-201ENST00000263233 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms