RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641487.1

CASC19-233, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 966 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-233	ENST00000641487	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF732	B4DXR9	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CFLAR	O15519	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RS1	O15537	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	UTS2	O95399	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ACP2	P11117	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CCL2	P13500	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	IL32	P24001	234 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ELK4	P28324	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	AGTR1	P30556	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GABRA3	P34903	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	HTR5A	P47898	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ATP12A	P54707	1039 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PLP1	P60201	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	C2orf80	Q0P641	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	P2RY6	Q15077	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	UNC50	Q53HI1	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	HBM	Q6B0K9	141 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RPS27L	Q71UM5	84 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GALNT10	Q86SR1	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	EME1	Q96AY2	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PELI1	Q96FA3	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	EBPL	Q9BY08	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MFF	Q9GZY8	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FLRT3	Q9NZU0	649 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FKBP7	Q9Y680	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	DOCK7	Q96N67	2140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MED12	Q93074	2177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CUBN	O60494	3623 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487		A0A1W2PP18	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487		A0A1W2PQD3	144 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487		H0YL77	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CCL24	O00175	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	P2RY10	O00398	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	FBP2	O00757	339 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CCS	O14618	274 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TNFSF11	O14788	317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CLOCK	O15516	846 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CXCL13	O43927	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GLA	P06280	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	SOD3	P08294	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MAP3K8	P41279	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CRAT	P43155	626 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	RFX3	P48380	749 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	DSCR9	P59020	149 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	TAB1	Q15750	504 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	NRF1	Q16656	503 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CASC19-233	ENST00000641487	GPR157	Q5UAW9	335 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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