RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 SPTSSAQ969W0 71 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 ASB9Q96DX5 294 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TECTBQ96PL2 329 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 DDOQ99489 341 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 PCGF1Q9BSM1 259 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 C1orf21Q9H246 121 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MARCH7Q9H992 704 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 SMURF1Q9HCE7 757 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 MMP24Q9Y5R2 645 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.47□□□□□ -1.05
MFGE8-216ENST00000613965 TVP23AA6NH52 213 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF879B4DU55 563 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 C3orf80F5H4A9 247 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 LGALS8O00214 317 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TNFRSF11BO00300 401 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 BHLHE40O14503 412 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ADAM20O43506 726 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 GMDSO60547 372 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 MMP9P14780 707 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CFHR2P36980 270 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 HMGA2P52926 109 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 KCNJ8Q15842 424 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CD276Q5ZPR3 534 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 DRAM2Q6UX65 266 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR9Q2Q8NGE9 314 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR56B2PQ8NGI1 322 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR4C15Q8NGM1 316 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR2T4Q8NH00 348 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 LRGUKQ96M69 825 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TBX15Q96SF7 602 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TRIM15Q9C019 465 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 NOX4Q9NPH5 578 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TAS2R1Q9NYW7 299 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.46□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 A0A1B0GUS0 222 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OOEPA6NGQ2 149 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 GGT3PA6NGU5 568 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 P2RY10O00398 339 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 FCN3O75636 299 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TOX4O94842 621 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CCNB2O95067 398 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 LIPFP07098 398 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 SLC2A1P11166 492 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 PRKXP51817 358 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 RAG2P55895 527 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 MS4A2Q01362 244 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR8B8Q15620 311 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 Q6YL49 198 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 LNX2Q8N448 690 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 GCSAMQ8N6F7 178 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 AQP11Q8NBQ7 271 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 OR2T29Q8NH02 315 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 WDFY2Q96P53 400 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 COPS4Q9BT78 406 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 THTPAQ9BU02 230 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 CHIAQ9BZP6 476 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 REEP1Q9H902 201 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 C1orf123Q9NWV4 160 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 IL20Q9NYY1 176 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.44□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 A6NLC8 198 aa8.44□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 ACOT8O14734 319 aa8.44□□□□□ -1.06
MFGE8-216ENST00000613965 NDUFA2O43678 99 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms