RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 EMC6Q9BV81 110 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PROK2Q9HC23 129 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPMQ9NSP4 180 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 KLK11Q9UBX7 282 aa22.39■■□□□ 1.18
CAPNS1-204ENST00000587718 CELSR2Q9HCU4 2923 aa22.39■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 MEIKINA0A087WXM9 373 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PNR3 127 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SNRPGP15A8MWD9 76 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GMDSO60547 372 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSM4P0C7M7 580 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PRSS3P35030 304 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB12Q6IQ22 244 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF529Q6P280 563 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC54Q8NEL0 328 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PBOV1Q9GZY1 135 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 LHFPL6Q9Y693 200 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TTRP02766 147 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CPN1P15169 458 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RAC1P63000 192 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAMEF20Q5VT98 475 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM54Q969K7 222 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R14AQ96A00 147 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PIGQQ9BRB3 760 aa22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPL8 197 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ICMTO60725 284 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 MELTFP08582 738 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FREM3P0C091 2139 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL3P10147 92 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 BDKRB2P30411 391 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CAMK2DQ13557 499 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC25A25Q6KCM7 469 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CREB3L2Q70SY1 520 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OR10S1Q8NGN2 331 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GPX8Q8TED1 209 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 DKKL1Q9UK85 242 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ITPR2Q14571 2701 aa22.37■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZIC3O60481 467 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CD46P15529 392 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CCL1P22362 96 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SRD5A2P31213 254 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GSK3AP49840 483 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GLYATL3Q5SZD4 288 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OTPQ5XKR4 325 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SPICQ8N5J4 248 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OR11H7Q8NGC8 314 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RADILQ96JH8 1075 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 NOX3Q9HBY0 568 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM138Q9NPI0 162 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB22AQ9UL26 194 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 POLR1DQ9Y2S0 133 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CENPEQ02224 2701 aa22.36■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SYT7O43581 403 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SP1P08047 785 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 AKAIN1P0CW23 69 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SFTPDP35247 375 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CA7P43166 264 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GPAT4Q86UL3 456 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PLPP7Q8NBV4 271 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5D14Q8NGL3 314 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GLTPQ9NZD2 209 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 LRFN1Q9P244 771 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.35■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAV18A0A075B6X5 111 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2M5A3KFT3 312 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 P2RY10O00398 339 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 DOK2O60496 412 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 BPNT1O95861 308 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 LPLP06858 475 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 QDPRP09417 244 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 EFNB2P52799 333 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM189A2Q15884 450 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF813Q6ZN06 617 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 LURAP1LQ8IV03 231 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC22A24Q8N4F4 322 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM229BQ8NBD8 167 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG5Q9H1Y0 275 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM185BQ9H7F4 350 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL21EPA6NDL7 271 aa22.33■■□□□ 1.17
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