RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574210.5

CLUH-209, Transcript of clustered mitochondria homolog, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLUH, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUH-209ENST00000574210 DHRS12A0PJE2 317 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 ZNF878C9JN71 531 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 GMDSO60547 372 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PLATP00750 562 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 RAP2AP10114 183 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 OR8B2Q96RD0 313 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 FEVQ99581 238 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 MED20Q9H944 212 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 MARCH7Q9H992 704 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 CENPMQ9NSP4 180 aa14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 FAM183AA6NL82 134 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 C22orf46C9J442 243 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PHYHO14832 338 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 IRF2P14316 349 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PRTN3P24158 256 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 GK3PQ14409 553 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 AWAT1Q58HT5 328 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 SPATC1Q76KD6 591 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 PARP8Q8N3A8 854 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 IQCF1Q8N6M8 205 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 AMELYQ99218 206 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 C1orf21Q9H246 121 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 RNF7Q9UBF6 113 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 CTSZQ9UBR2 303 aa14.53□□□□□ -0.08
CLUH-209ENST00000574210 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GGT3PA6NGU5 568 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 RIIAD1A6NNX1 92 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 LGALS8O00214 317 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 FCN3O75636 299 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 IFNGP01579 166 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ZNF3P17036 446 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GRK5P34947 590 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 BLVRAP53004 296 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 C3orf56Q8N813 242 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 RNF133Q8WVZ7 376 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 DUX5Q96PT3 197 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 CHID1Q9BWS9 393 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 OPA3Q9H6K4 179 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 CLN8Q9UBY8 286 aa14.52□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 XRCC2O43543 280 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 HKR1P10072 659 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 CX3CR1P49238 355 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 FAM3AP98173 230 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 TAF13Q15543 124 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 KLHL12Q53G59 568 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 WDR86Q86TI4 376 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 TIGD4Q8IY51 512 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 TEX47Q8TBZ9 253 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GIPC3Q8TF64 312 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 SGK3Q96BR1 496 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 INTS14Q96SY0 518 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ABHD6Q9BV23 337 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.51□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 C3orf80F5H4A9 247 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GLCEO94923 617 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 CST1P01037 141 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 LHBP01229 141 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 GSTT1P30711 240 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 OPRL1P41146 370 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 SPERTQ8NA61 448 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 TOR3AQ9H497 397 aa14.5□□□□□ -0.09
CLUH-209ENST00000574210 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms