RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 AMIGO2Q86SJ2 522 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 DEFB108BQ8NET1 73 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 NRBF2Q96F24 287 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 REEP6Q96HR9 211 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TOR3AQ9H497 397 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM165Q9HC07 324 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SVEP1Q4LDE5 3571 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIAL4DF5H284 164 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 M0R129 80 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRODHO43272 600 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRPP07492 148 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OPRL1P41146 370 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 HCCSP53701 268 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOFQ13790 326 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ESCO2Q56NI9 601 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC16A9Q7RTY1 509 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf87Q8N0U7 546 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OTOSQ8NHW6 89 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SGK3Q96BR1 496 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PGAM5Q96HS1 289 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC22A4Q9H015 551 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 AP4S1Q9Y587 144 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 G3V2T6 193 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAPPC2LH3BP13 241 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 J3QLI3 93 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMD9O00233 223 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPHA1P21709 976 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FASP25445 335 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 GATA4P43694 442 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM3AP98173 230 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC35D3Q5M8T2 416 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJC9Q8WXX5 260 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR10A2Q9H208 303 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 FN3KRPQ9HA64 309 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 KRT84Q9NSB2 600 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 OPN4Q9UHM6 478 aa14.9□□□□□ -0.02
CTDNEP1-207ENST00000572043 A6NLC8 198 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRKYO43930 277 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GMDSO60547 372 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 WNT2P09544 360 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLC2A5P22732 501 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CD80P33681 288 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF404Q494X3 552 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1QL2Q7Z5L3 287 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLBQ86Z14 1044 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR8S1Q8NH09 359 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPSB4Q96A44 273 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OPA3Q9H6K4 179 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 SP140LQ9H930 580 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 C1orf123Q9NWV4 160 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC182A6NF36 153 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 CIB2O75838 187 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 VENTXO95231 258 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 APOC1P02654 83 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GATA3P23771 443 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPHA2P29317 976 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 GNB2P62879 340 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF154Q13106 437 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 PARP8Q8N3A8 854 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 TEX29Q8N6K0 151 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.88□□□□□ -0.03
CTDNEP1-207ENST00000572043 NANPQ8TBE9 248 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms