RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	PSG4	Q00888	419 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	COX10	Q12887	443 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	APOF	Q13790	326 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GK3P	Q14409	553 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PDCD1	Q15116	288 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SHF	Q7M4L6	423 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CPO	Q8IVL8	374 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TMEM86B	Q8N661	226 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ABHD4	Q8TB40	342 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FNDC8	Q8TC99	324 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C4orf45	Q96LM5	186 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	COG8	Q96MW5	612 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WAC	Q9BTA9	647 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TOR3A	Q9H497	397 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NOX4	Q9NPH5	578 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CMC2	Q9NRP2	79 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MIOX	Q9UGB7	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IL19	Q9UHD0	177 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	ZAR1L	A6NP61	321 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SRRM5	B3KS81	715 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PSMD9	O00233	223 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NDUFA7	O95182	113 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DBH	P09172	617 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CST2	P09228	141 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	WNT2	P09544	360 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CRABP1	P29762	137 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HTR5A	P47898	357 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PAX2	Q02962	417 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	PSG7	Q13046	419 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C12orf73	Q69YU5	71 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	BRICD5	Q6PL45	260 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SYT9	Q86SS6	491 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR2T4	Q8NH00	348 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	NRG4	Q8WWG1	115 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	DDO	Q99489	341 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TBX5	Q99593	518 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CITED1	Q99966	193 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MSL2	Q9HCI7	577 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		5.74	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CCDC182	A6NF36	153 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	SGCE	O43556	437 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IDH3B	O43837	385 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	HMGN1	P05114	100 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	LIPF	P07098	398 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		5.73	□□□□□ -1.49
CS-233	ENST00000552688	COX5B	P10606	129 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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