RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 F5H5P2 479 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 SBK2P0C263 348 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ANPEPP15144 967 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 CA6P23280 308 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 KRTAP1-1Q07627 177 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 POU4F2Q12837 409 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 RHOUQ7L0Q8 258 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 RFLNBQ8N5W9 214 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 OR10H4Q8NGA5 316 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 RAB1CQ92928 201 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 MEGF10Q96KG7 1140 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 MNTQ99583 582 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 CLN6Q9NWW5 311 aa16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 FN1P02751 2386 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 INAFM1C9JVW0 142 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 MLNRO43193 412 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 TACSTD2P09758 323 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 CFL1P23528 166 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 EFNB1P98172 346 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 CLDND2Q8NHS1 167 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 UBE2FQ969M7 185 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 OR8B4Q96RC9 309 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16.11■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 IL2RGP31785 369 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 C6orf52Q5T4I8 152 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 LPCAT4Q643R3 524 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 MOGAT3Q86VF5 341 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF679Q8IYX0 411 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 GAL3ST1Q99999 423 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 SLC22A4Q9H015 551 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 TMEM106BQ9NUM4 274 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 UBAP1Q9NZ09 502 aa16.1■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 SNTNA6NMZ2 147 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 A8MV72 311 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ENTPD6O75354 484 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF254O75437 659 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 KRT8P05787 483 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 PEX2P28328 305 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 GNALP38405 381 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 OR8S1Q8NH09 359 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 CYGBQ8WWM9 190 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 SGK3Q96BR1 496 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 APOL4Q9BPW4 351 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 RGCCQ9H4X1 137 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 DCAF16Q9NXF7 216 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 KCNS2Q9ULS6 477 aa16.09■□□□□ 0.17
PITX1-204ENST00000504936 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 PRR32B1ATL7 298 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 WNT9BO14905 357 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 TGFAP01135 160 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 IRF2P14316 349 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 RBMXP38159 391 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 DDOSTP39656 456 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MTNR1AP48039 350 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MMP16P51512 607 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 CDH15P55291 814 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 RIPPLY3P57055 190 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 FAM3AP98173 230 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 TMED1Q13445 227 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MEDAGQ5VYS4 303 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 FAM166AQ6J272 317 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 PRSS45Q7RTY3 260 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 FTMTQ8N4E7 242 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 SPSB4Q96A44 273 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 RNFT2Q96EX2 444 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 LPAR2Q9HBW0 351 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 UFSP2Q9NUQ7 469 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 ZNF319Q9P2F9 582 aa16.08■□□□□ 0.16
PITX1-204ENST00000504936 AASSQ9UDR5 926 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms