RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2AG2	A6NM03	316 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0YL77	283 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HMGN4	O00479	90 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GJB3	O75712	270 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFB2	O95178	105 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLDN7	O95471	211 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	UMOD	P07911	640 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FAM157C	P0CG43	387 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PNLIP	P16233	465 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GALR1	P47211	349 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC6A9	P48067	706 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPY4R	P50391	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MORN4	Q8NDC4	146 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASB11	Q8WXH4	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf198	Q9H425	327 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4A8	P0C604	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	STAG3L3	P0CL85	134 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IRF1	P10914	325 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PMPCA	Q10713	525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF74	Q16587	644 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SCD5	Q86SK9	330 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SULF2	Q8IWU5	870 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	STARD4	Q96DR4	205 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GINS3	Q9BRX5	216 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT9	Q9BW91	350 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA1456	Q9P272	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIAS2	O75928	621 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADH1B	P00325	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	LGALS2	P05162	132 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CXCL1	P09341	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HRH1	P35367	487 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGSF8	Q969P0	613 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	C17orf105	B2RV13	164 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR7C2	O60412	319 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAMP1	O60894	148 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	HPN	P05981	417 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFTPD	P35247	375 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGR3	Q06889	387 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPR18	Q14330	331 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	DACT2	Q5SW24	774 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSLP	Q969D9	159 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTIF3	Q9H2K0	278 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSL2	Q9HCI7	577 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBX21	Q9UL17	535 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A0D9SEW6	157 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERPINE3	A8MV23	424 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SFT2D2	O95562	160 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD99	P14209	185 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC6A12	P48065	614 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ERVS71-1	P61550	626 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBX1	P62877	108 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PAFAH1B2	P68402	229 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF85	Q03923	595 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	MST1L	Q2TV78	715 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		7.37	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms