RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.76□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF878C9JN71 531 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 BHLHE40O14503 412 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ADAM20O43506 726 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CST1P01037 141 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GYPAP02724 150 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PSKH1P11801 424 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SPI1P17947 270 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 OMGP23515 440 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GNALP38405 381 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC15A1P46059 708 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FGF12P61328 243 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MS4A2Q01362 244 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MAB21L1Q13394 359 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF404Q494X3 552 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SPATS1Q496A3 300 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 AWAT1Q58HT5 328 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DRAM2Q6UX65 266 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FAM57BQ71RH2 274 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SPATA24Q86W54 205 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZDHHC22Q8N966 263 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ST8SIA4Q92187 359 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A28Q96A46 364 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PGAM5Q96HS1 289 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 INTS14Q96SY0 518 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 FEVQ99581 238 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ15Q99712 375 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TRIM15Q9C019 465 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 IL20Q9NYY1 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DHRS12A0PJE2 317 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GMDSO60547 372 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TOX4O94842 621 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 H2BFMP0C1H6 154 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 RAP2AP10114 183 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CALB2P22676 271 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ANOS1P23352 680 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GSTT1P30711 240 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MTNR1AP48039 350 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MZT1Q08AG7 82 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GINS1Q14691 196 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KCNJ8Q15842 424 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GPR157Q5UAW9 335 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 COMMD2Q86X83 199 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 LRRC29Q8WV35 223 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 REEP6Q96HR9 211 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CHID1Q9BWS9 393 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SLC22A4Q9H015 551 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MUC13Q9H3R2 512 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.74□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM89A2RUT3 159 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 OOEPA6NGQ2 149 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ANXA2P2A6NMY6 339 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 A8MXK9 166 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 LGALS8O00214 317 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 TMPRSS2O15393 492 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 GYG2O15488 501 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 XRCC2O43543 280 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SELENOFO60613 162 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 CRYBA1P05813 215 aa6.73□□□□□ -1.33
CTPS1-209ENST00000480420 SFTPBP07988 381 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms