RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 UBE2FQ969M7 185 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PGAM5Q96HS1 289 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SIGLEC11Q96RL6 698 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR10A2Q9H208 303 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TMEM160Q9NX00 188 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa17.68■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM157AC9JC47 383 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LMX1BO60663 402 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SBK2P0C263 348 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MMP16P51512 607 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ROM1Q03395 351 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TIGD6Q17RP2 521 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SLC35F2Q8IXU6 374 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM81AQ8TBF8 368 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ASB17Q8WXJ9 295 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 EME1Q96AY2 570 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR8B4Q96RC9 309 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MBOAT4Q96T53 435 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 SLC22A4Q9H015 551 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
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ACTB-211ENST00000480301 DYSFO75923 2080 aa17.67■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TANC2Q9HCD6 1990 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa17.66■□□□□ 0.42
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ACTB-211ENST00000480301 IGHV2-70P01814 119 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 HTR1FP30939 366 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 DDOSTP39656 456 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 PMELP40967 661 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CD200P41217 278 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ZNF679Q8IYX0 411 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR51G2Q8NGK0 314 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MNTQ99583 582 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 MROQ9BYG7 248 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TTTY10Q9BZA0 68 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 RGCCQ9H4X1 137 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ZNF665Q9H7R5 613 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CLN6Q9NWW5 311 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 KCNS2Q9ULS6 477 aa17.66■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 TMEM178BH3BS89 294 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 IFNL4K9M1U5 179 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GMDSO60547 372 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 DCTDP32321 178 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GATA4P43694 442 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 GSK3AP49840 483 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 CXCR4P61073 352 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 OR8G1Q15617 311 aa17.65■□□□□ 0.42
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
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ACTB-211ENST00000480301 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 STMN2Q93045 179 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 LYZL4Q96KX0 146 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 FAM206AQ9NX38 181 aa17.65■□□□□ 0.42
ACTB-211ENST00000480301 ACOD1A6NK06 481 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 B4DSR2 109 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PHYHO14832 338 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF254O75437 659 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 IGHV2-5P01817 119 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CFL1P23528 166 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TMED1Q13445 227 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF181Q2M3W8 571 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SLC25A30Q5SVS4 291 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR8B12Q8NGG6 310 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 IMPAD1Q9NX62 359 aa17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ISPDA4D126 451 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ANKRD65E5RJM6 399 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 RIDAP52758 137 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ZMYND11Q15326 602 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 OR8B8Q15620 311 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 KLBQ86Z14 1044 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ERGIC1Q969X5 290 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 GAL3ST1Q99999 423 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 APOL4Q9BPW4 351 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 IKZF2Q9UKS7 526 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 JMJD1CQ15652 2540 aa17.63■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD6O75354 484 aa17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
ACTB-211ENST00000480301 APOL3O95236 402 aa17.62■□□□□ 0.41
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