RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 FUT1P19526 365 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 BTF3P20290 206 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LAP3P28838 519 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MPIP34949 423 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HSD17B3P37058 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CD200P41217 278 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CDKN2CP42773 168 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CRATP43155 626 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR3A4PP47883 348 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 GLIPR1P48060 266 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 POU3F4P49335 361 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RGS6P49758 472 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ENTPD1P49961 510 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MVDP53602 400 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 BIDP55957 195 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SELENOVP59797 346 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTAP10-1P60331 282 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ERVFC1-1P60608 527 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPS23P62266 143 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HBA1P69905 142 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PSPHP78330 225 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCNJ10P78508 379 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF45Q02386 682 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC3A1Q07837 685 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ACSM1Q08AH1 577 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 IFT88Q13099 833 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PTGR1Q14914 329 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KIR2DS1Q14954 304 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SSX2Q16385 188 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 AANATQ16613 207 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PCK2Q16822 640 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF718Q3SXZ3 478 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRT71Q3SY84 523 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KLHL12Q53G59 568 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ODF2Q5BJF6 829 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 XKR7Q5GH72 579 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SEL1L2Q5TEA6 688 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LIPMQ5VYY2 423 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TEX36Q5VZQ5 186 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ATG16L1Q676U5 607 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 STUMQ69YW2 141 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TMEM225Q6GV28 225 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ACSM6Q6P461 480 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF767PQ75MW2 155 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 C16orf82Q7Z2V1 217 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SZRD1Q7Z422 152 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPATA12Q7Z6I5 190 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LYG2Q86SG7 212 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARMC8Q8IUR7 673 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF695Q8IW36 515 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HSCBQ8IWL3 235 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRC8AQ8IWT6 810 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC30A8Q8IWU4 369 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 DEFB125Q8N687 156 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 IQCF1Q8N6M8 205 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RNF152Q8N8N0 203 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCDC89Q8N998 374 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPERTQ8NA61 448 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNRF1Q8ND25 227 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPEPL1Q8NDH3 523 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC26A10Q8NG04 563 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR11H1Q8NG94 326 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR7A2PQ8NGA2 310 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR4D11Q8NGI4 311 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR5M8Q8NGP6 311 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR4Q3Q8NH05 313 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF563Q8TA94 476 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PSMA8Q8TAA3 256 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 GLMPQ8WWB7 406 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SELENOMQ8WWX9 145 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARPC1AQ92747 370 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 UBE2E3Q969T4 207 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MCHR2Q969V1 340 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TUBGCP3Q96CW5 907 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HAVCR1Q96D42 359 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MED30Q96HR3 178 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CYYR1Q96J86 154 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MPP4Q96JB8 637 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms