RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 OPA3Q9H6K4 179 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF665Q9H7R5 613 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRL4Q9HBW9 690 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 NPTNQ9Y639 398 aa12.59□□□□□ -0.39
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A31A6NKX4 558 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 APOL3O95236 402 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV2-70P01814 119 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV2-5P01817 119 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 APOC1P02654 83 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 PMELP40967 661 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SRP9P49458 86 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TIGD6Q17RP2 521 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 KRT77Q7Z794 578 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MOGAT3Q86VF5 341 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 GID4Q8IVV7 300 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35F2Q8IXU6 374 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR8B12Q8NGG6 310 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2FQ969M7 185 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 LYZL4Q96KX0 146 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR8B4Q96RC9 309 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MBOAT4Q96T53 435 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SLC29A1Q99808 456 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 GAL3ST1Q99999 423 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR10A2Q9H208 303 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM160Q9NX00 188 aa12.58□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CUBNO60494 3623 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 JMJD1CQ15652 2540 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM178BH3BS89 294 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF205O95201 554 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SBK2P0C263 348 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CD200P41217 278 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 RAD23AP54725 363 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CXCR4P61073 352 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR8G1Q15617 311 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SSX6Q7RTT6 188 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR52H1Q8NGJ2 320 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR51G2Q8NGK0 314 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR8J1Q8NGP2 316 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 EME1Q96AY2 570 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HRASLS5Q96KN8 279 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SP140LQ9H930 580 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 FAM206AQ9NX38 181 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HAO2Q9NYQ3 351 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 UBAP1Q9NZ09 502 aa12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 B4DSR2 109 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD65E5RJM6 399 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 HTR1FP30939 366 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 GATA4P43694 442 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 GSK3AP49840 483 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CDC42P60953 191 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 BTG1P62324 171 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ROM1Q03395 351 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZMYND11Q15326 602 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MPPED2Q15777 294 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CR1LQ2VPA4 569 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CHRFAM7AQ494W8 412 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 FAM201AQ5SY85 155 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF679Q8IYX0 411 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TBX5Q99593 518 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 SLC22A4Q9H015 551 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 NIPAL2Q9H841 368 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 UFSP2Q9NUQ7 469 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CLN6Q9NWW5 311 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 IKZF2Q9UKS7 526 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ORC6Q9Y5N6 252 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa12.56□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 FAM20BO75063 409 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 BAG2O95816 211 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 MSMBP08118 114 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ACKR3P25106 362 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 OR8B8Q15620 311 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 ASB17Q8WXJ9 295 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM186Q96B77 213 aa12.55□□□□□ -0.4
CSAG1-201ENST00000361211 RAB39BQ96DA2 213 aa12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms