RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 VWA1Q6PCB0 445 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 Q6ZSR3 168 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR4M2Q8NGB6 313 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SGK3Q96BR1 496 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 WACQ9BTA9 647 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CKLFQ9UBR5 152 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM127O75204 238 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CSF3P09919 207 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKACBP22694 351 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC36A2Q495M3 483 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 HIKESHIQ53FT3 197 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 COMMD2Q86X83 199 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC25A28Q96A46 364 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TNFSF13O75888 250 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 APOC1P02654 83 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CALCBP10092 127 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NAT2P11245 290 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IL7P13232 177 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHV1-2P23083 117 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CXADRP78310 365 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IFITM2Q01629 132 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IL18Q14116 193 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OXA1LQ15070 435 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DOK3Q7L591 496 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF144BQ7Z419 303 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP14Q86UN6 197 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ABHD1Q96SE0 405 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC17A2O00624 439 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1QTNF9P0C862 333 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TDGF1P3P51864 188 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8H2Q8N162 312 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52H1Q8NGJ2 320 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNK15Q9H427 330 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GYS6 101 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ISPDA4D126 451 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.113e-7■■■□□ 15.6
RABGEF1-201ENST00000284957 GNALP38405 381 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 UCNP55089 124 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TNK1Q13470 666 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PYDC2Q56P42 97 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 BIVMQ86UB2 503 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR51D1Q8NGF3 324 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPKCQ96DU7 683 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF75AQ96N20 296 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RNF121Q9H920 327 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ICMTO60725 284 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS3O75911 302 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CCL2P13500 99 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ID4P47928 161 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB1AP62820 205 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AS1Q8N127 324 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 POC5Q8NA72 575 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NAXEQ8NCW5 288 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CMTM3Q96MX0 182 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PQ09 198 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 LCATP04180 440 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CD79AP11912 226 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 EDN3P14138 238 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ACKR3P25106 362 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PITPNBP48739 271 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS12P56730 875 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.12□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms