RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 POU4F2Q12837 409 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MEDAGQ5VYS4 303 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR10AD1Q8NGE0 317 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR2T27Q8NH04 317 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ITLN1Q8WWA0 313 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R14AQ96A00 147 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 REEP6Q96HR9 211 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MROQ9BYG7 248 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SP140LQ9H930 580 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM100Q9NV29 134 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 DCAF16Q9NXF7 216 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 IL19Q9UHD0 177 aa18.86■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ABCA2Q9BZC7 2435 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MTNR1AP48039 350 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR8B12Q8NGG6 310 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR56B2PQ8NGI1 322 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PGAM5Q96HS1 289 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR2V2Q96R30 315 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TBX5Q99593 518 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 EGLN1Q9GZT9 426 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OR10A2Q9H208 303 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 OPA3Q9H6K4 179 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 C8orf4Q9NR00 106 aa18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 LRP5LA4QPB2 252 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 F5H5P2 479 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PHYHO14832 338 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 CLIC3O95833 236 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 HEXAP06865 529 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 IL2RGP31785 369 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MMP16P51512 607 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ZNF85Q03923 595 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 EGR3Q06889 387 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MAB21L1Q13394 359 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 RNFT2Q96EX2 444 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MEGF10Q96KG7 1140 aa18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 GGT3PA6NGU5 568 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 ACOD1A6NK06 481 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 WBP4O75554 376 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 IGLV3-1P01715 115 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 GSK3AP49840 483 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 RIDAP52758 137 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 TIGD6Q17RP2 521 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 NRG4Q8WWG1 115 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 CCL17Q92583 94 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 G6PC2Q9NQR9 355 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 IKZF2Q9UKS7 526 aa18.83■□□□□ 0.61
SYF2-201ENST00000236273 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP18.83■□□□□ 0.61e-8■□□□□ 10.5
SYF2-201ENST00000236273 FN1P02751 2386 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MPZL2O60487 215 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-31P0DP07 118 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CA6P23280 308 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF4P23510 183 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ACKR3P25106 362 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PMELP40967 661 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SLC34A1Q06495 639 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 OR8B8Q15620 311 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 HFEQ30201 348 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF691Q5VV52 312 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 OR10H4Q8NGA5 316 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 LGALS12Q96DT0 336 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PBOV1Q9GZY1 135 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 RGCCQ9H4X1 137 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 GCM1Q9NP62 436 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 AMBNQ9NP70 447 aa18.82■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 PPIHO43447 177 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF1AP19438 455 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 DDOSTP39656 456 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ISL1P61371 349 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF91Q05481 1191 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 GFOD2Q3B7J2 385 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF555Q8NEP9 628 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 ZNF649Q9BS31 505 aa18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 A0A0U1RQV5 110 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 CD5LO43866 347 aa18.8■□□□□ 0.6
SYF2-201ENST00000236273 TTRP02766 147 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms