RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639895.1

SPIN3-231, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 4,234 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CORO2A	Q92828	525 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	EID2B	Q96D98	161 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SCN4A	P35499	1836 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895		B4E171	279 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	NXPH3	O95157	252 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	FOLR2	P14207	255 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	KLK2	P20151	261 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	HERPUD1	Q15011	391 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895		Q5PR19	223 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895		A0A0G2JK05	382 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895		E5RGE8	158 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CYBA	P13498	195 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CD70	P32970	193 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ACTR1B	P42025	376 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SULT1A2	P50226	295 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	IL10RA	Q13651	578 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	BANF2	Q9H503	90 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	WBP1L	Q9NX94	342 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	NSG2	Q9Y328	171 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CD200	P41217	278 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	LBX1	P52954	281 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TPGS2	Q68CL5	300 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	EXD3	Q8N9H8	876 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	WDR76	Q9H967	626 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895		H0YL77	283 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OGG1	O15527	345 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLCO2B1	O94956	709 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	HTR3D	Q70Z44	454 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SEH1L	Q96EE3	360 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SPIN2A	Q99865	258 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	FAM117A	Q9C073	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	KLKB1	P03952	638 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CTSA	P10619	480 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SFTPD	P35247	375 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TAS2R46	P59540	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP2CB	P62714	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PPP2CA	P67775	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZNF92	Q03936	586 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	DLEU1	O43261	78 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	HCRTR2	O43614	444 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	PGA3	P0DJD8	388 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	REEP5	Q00765	189 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	LGI3	Q8N145	548 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	FGGY	Q96C11	551 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SPIN3-231	ENST00000639895	CERS4	Q9HA82	394 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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