RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635733.1

FASN-208, Transcript of fatty acid synthase, human

TSL 5

Gene FASN, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FASN-208	ENST00000635733	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CDK5R2	Q13319	367 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	RIN1	Q13671	783 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	TAF13	Q15543	124 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	USP51	Q70EK9	711 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	FAM57B	Q71RH2	274 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF786	Q8N393	782 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	FAM168A	Q92567	244 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SPSB4	Q96A44	273 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SGK3	Q96BR1	496 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	LYZL4	Q96KX0	146 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	RDH12	Q96NR8	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR8B4	Q96RC9	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	APOL4	Q9BPW4	351 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	REG4	Q9BYZ8	158 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	AMBN	Q9NP70	447 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	BRD7	Q9NPI1	651 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CLN6	Q9NWW5	311 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	FAM206A	Q9NX38	181 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	NKIRAS2	Q9NYR9	191 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24	1e-13	■□□□□ 8.7
FASN-208	ENST00000635733	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	WNT9B	O14905	357 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	TBX1	O43435	398 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CDC14B	O60729	498 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	HLA-DPB1	P04440	258 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CD55	P08174	381 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SELE	P16581	610 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	GIF	P27352	417 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	HSD11B1	P28845	292 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PDLIM4	P50479	330 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ISL1	P61371	349 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	FAM3A	P98173	230 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF85	Q03923	595 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF91	Q05481	1191 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SLC34A1	Q06495	639 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CARTPT	Q16568	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF691	Q5VV52	312 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	BIVM	Q86UB2	503 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR8G5	Q8NG78	346 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SNX33	Q8WV41	574 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CYGB	Q8WWM9	190 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	LGALS12	Q96DT0	336 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	RNFT2	Q96EX2	444 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	C18orf12	Q96KH6	178 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	COG8	Q96MW5	612 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ZNF649	Q9BS31	505 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	TREM2	Q9NZC2	230 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24	3e-32	■□□□□ 10.3
FASN-208	ENST00000635733	HIVEP2	P31629	2446 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	PLSCR5	A0PG75	271 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	CD300LB	A8K4G0	201 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733		F5H5P2	479 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	IGLV3-1	P01715	115 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	INHBB	P09529	407 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	OR2T7	P0C7T2	308 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	ACKR3	P25106	362 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	NR4A2	P43354	598 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	MTNR1A	P48039	350 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	DSCR9	P59020	149 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FASN-208	ENST00000635733	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms