RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf105B2RV13 164 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NPIPB9F8W1W9 429 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf65H3BRN8 121 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DS3K7RE56 304 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 AIPO00170 330 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NKX2-8O15522 239 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SOX15O60248 233 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PRAMEF10O60809 474 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK2O95069 426 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFA7O95182 113 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 LRATO95237 230 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HAND1O96004 215 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 IGHG3P01860 377 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SHBGP04278 402 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FGF2P09038 288 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SBK3P0C264 359 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L2P0CJ85 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L3P0CJ86 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L5P0CJ88 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L6P0CJ89 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DUX4L7P0CJ90 424 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MPC1LP0DKB6 136 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C7P0DN81 318 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 T-ENOLP0DO92 83 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2D6P10635 497 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HGFP14210 728 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HOXB2P14652 356 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF43P17038 809 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ADORA2BP29275 332 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 EPHA3P29320 983 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GABRA5P31644 462 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HSD17B3P37058 310 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GLP1RP43220 463 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR3A4PP47883 348 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SULT1A1P50225 295 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SULT1A2P50226 295 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 EFNB2P52799 333 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GEMP55040 296 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PAX9P55771 341 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM50BP56557 158 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R50P59544 299 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 HBA1P69905 142 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 DCDP81605 110 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZXDBP98169 803 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PSG6Q00889 435 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCDQ05655 676 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SLC18A2Q05940 514 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF844Q08AG5 666 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GPR17Q13304 367 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 FHL3Q13643 280 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 EDDM3AQ14507 147 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DS3Q14952 304 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 NECTIN1Q15223 517 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SHHQ15465 462 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR1Q1Q15612 314 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZIC1Q15915 447 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF77Q15935 545 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A18Q3C1V0 323 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TTLL9Q3SXZ7 439 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CYBRD1Q53TN4 286 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 VWA2Q5GFL6 755 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SOHLH1Q5JUK2 328 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD54Q6NXT1 300 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 AADACL2Q6P093 401 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf89Q6UX73 402 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF66Q6ZN08 573 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF620Q6ZNG0 422 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZSR9 355 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ASCL5Q7RTU5 278 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS48Q7RTY5 328 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 MDGA2Q7Z553 956 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CLNKQ7Z7G1 428 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SNX29P2Q8IUI4 249 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 LYG1Q8N1E2 194 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 CBR4Q8N4T8 237 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 SLC30A7Q8NEW0 376 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR5AU1Q8NGC0 362 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR4D11Q8NGI4 311 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR1F12Q8NHA8 337 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 OR14L1PQ8NHC6 308 aa2.67□□□□□ -1.98
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