RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560185.1

AKAP13-215, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 2

Gene AKAP13, Length 611 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-215	ENST00000560185	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	VCX	Q9H320	206 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	IL19	Q9UHD0	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.57	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	HEXA	P06865	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ADH4	P08319	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SBK2	P0C263	348 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2T7	P0C7T2	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GIF	P27352	417 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	DDOST	P39656	456 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF121	P58317	390 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF92	Q03936	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	AMELY	Q99218	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RGCC	Q9H4X1	137 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.56	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	USF3	Q68DE3	2245 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ACOD1	A6NK06	481 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185		H0YHG0	523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PSMD9	O00233	223 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CD55	P08174	381 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CHN2	P52757	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CXCR4	P61073	352 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	EGR3	Q06889	387 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SNCB	Q16143	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OCLN	Q16625	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	FTMT	Q8N4E7	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RAB1C	Q92928	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	UBE2F	Q969M7	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	REEP6	Q96HR9	211 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LRP12	Q9Y561	859 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.55	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	VWC2L	B2RUY7	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ENTPD6	O75354	484 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	NCR1	O76036	304 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	KRT8	P05787	483 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	DCTD	P32321	178 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MTNR1A	P48039	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ROM1	Q03395	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RIN1	Q13671	783 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LPCAT4	Q643R3	524 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR2V2	Q96R30	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SMR3A	Q99954	134 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.54	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SLC16A6	O15403	523 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	GMDS	O60547	372 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	LY6G6D	O95868	133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	OR8G1	Q15617	311 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185		Q6ZR03	302 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	RNFT2	Q96EX2	444 aa		13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
AKAP13-215	ENST00000560185	TBX5	Q99593	518 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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