RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PRSS37	A4D1T9	235 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C5orf49	A4QMS7	147 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TVP23A	A6NH52	213 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		G3V2T6	193 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NDUFS7	O75251	213 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IGF2	P01344	180 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IFNG	P01579	166 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SERPINA5	P05154	406 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GYPB	P06028	91 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SOD3	P08294	240 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ADRA2A	P08913	450 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CD99	P14209	185 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF23	P17027	643 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GSTM3	P21266	225 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MSR1	P21757	451 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PAX7	P23759	505 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FAS	P25445	335 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	STOM	P27105	288 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CRABP1	P29762	137 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CALCR	P30988	508 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RAD52	P43351	418 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GSS	P48637	474 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOV	P59797	346 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PCBD1	P61457	104 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PSG4	Q00888	419 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FHL1	Q13642	323 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	GINS1	Q14691	196 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MEP1B	Q16820	701 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL12	Q53G59	568 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MEST	Q5EB52	335 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		Q5PR19	223 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF774	Q6NX45	483 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SVOPL	Q8N434	492 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4F15	Q8NGB8	312 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MED20	Q9H944	212 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	NOX3	Q9HBY0	568 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		4	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ITPR3	Q14573	2671 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C68	A6NDL8	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CGB1	A6NKQ9	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM183A	A6NL82	134 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	CENPBD1	B2RD01	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	SGCE	O43556	437 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	IDH3B	O43837	385 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	AHCYL1	O43865	530 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	DOK2	O60496	412 aa		3.99	□□□□□ -1.77
ATXN3-238	ENST00000556288	TMCC2	O75069	709 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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