RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544514.1

ANKRD49-209, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD49, Length 587 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-209ENST00000544514 G3V2L1 256 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 H3BQF6 201 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CHEK1O14757 476 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CXCL13O43927 109 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KIAA0513O60268 411 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KCNK2O95069 426 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KRT6AP02538 564 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KRT6BP04259 564 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 GSTA1P08263 222 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ADORA3P0DMS8 318 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TSPAN8P19075 237 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 EDNRAP25101 427 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 IL12BP29460 328 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ACVR1BP36896 505 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 EIF1P41567 113 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KRT6CP48668 564 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ATP5J2P56134 94 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 DNAJB13P59910 316 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 NAA20P61599 178 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 HERV-K104P63124 156 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 C2orf54Q08AI8 447 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PDK3Q15120 406 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CEP85LQ5SZL2 805 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 DDI2Q5TDH0 399 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TMEM107Q6UX40 140 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CNPY4Q8N129 248 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CDRT4Q8N9R6 151 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 OR5M1Q8NGP8 315 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ACMSDQ8TDX5 336 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ABHD3Q8WU67 409 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 LIPHQ8WWY8 451 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SLCO4A1Q96BD0 722 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 S100PBPQ96BU1 408 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 LINC00479Q96M42 142 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 RNF145Q96MT1 663 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CCT7Q99832 543 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PKP2Q99959 881 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FUNDC2Q9BWH2 189 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SRXN1Q9BYN0 137 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 RAB17Q9H0T7 212 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PTGES2Q9H7Z7 377 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PLEKHA3Q9HB20 300 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PLCE1Q9P212 2302 aa3.5□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 OR5H1A6NKK0 313 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ZNF716A6NP11 495 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SMIM24O75264 130 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SDC1P18827 310 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 AHCYP23526 432 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FCGR2CP31995 323 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PHBP35232 272 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PITPNBP48739 271 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FHITP49789 147 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SSTP61278 116 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 H3F3AP84243 136 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ZNF117Q03924 483 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 BSPH1Q075Z2 132 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 FOXF1Q12946 379 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 MEF2DQ14814 521 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 NRF1Q16656 503 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 ECSCRQ19T08 205 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TMEM249Q2WGJ8 235 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 XKR7Q5GH72 579 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 CBLN3Q6UW01 205 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 P4HA3Q7Z4N8 544 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.49□□□□□ -1.85
ANKRD49-209ENST00000544514 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms