RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	CLDN1	O95832	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	BCKDHB	P21953	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	OPRM1	P35372	400 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PRRT4	C9JH25	899 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ISOC2	Q96AB3	205 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	GPR84	Q9NQS5	396 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	HTR5A	P47898	357 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	TSLP	Q969D9	159 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	CRH	P06850	196 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	SST	P61278	116 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	YPEL5	P62699	121 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ADAM19	Q9H013	955 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	CTSF	Q9UBX1	484 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	BTBD17	A6NE02	478 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF749	O43361	778 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	MB	P02144	154 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PIGP	P57054	158 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	HSF1	Q00613	529 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF77	Q15935	545 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	GJC3	Q8NFK1	279 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	TEX101	Q9BY14	249 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	IL23A	Q9NPF7	189 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	PLSCR5	A0PG75	271 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ERVK-16	P61578	105 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	AWAT1	Q58HT5	328 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	GPX8	Q8TED1	209 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.77	□□□□□ -0.36
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PPH5	198 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	AKR7A3	O95154	331 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574		P04436	131 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	FPR2	P25090	351 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	LIMS1	P48059	325 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35A1	P78382	337 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	NECAP1	Q8NC96	275 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	CMBL	Q96DG6	245 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	TMEM68	Q96MH6	324 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	ARV1	Q9H2C2	271 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PRO1933	Q9H354	126 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	AGBL4	Q5VU57	503 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	HSPB6	O14558	160 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SFT2D2	O95562	160 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	ARG1	P05089	322 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PPIC	P45877	212 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PCBD1	P61457	104 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	OR2A2	Q6IF42	318 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	MAP3K3	Q99759	626 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	LAT2	Q9GZY6	243 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	CHRNA9	Q9UGM1	479 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	LRP12	Q9Y561	859 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKD1-222	ENST00000496574	SEC16A	O15027	2179 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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