RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RBBP9	O75884	186 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RCBTB2	O95199	551 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OXT	P01178	125 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CD74	P04233	296 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TALDO1	P37837	337 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SERPINB8	P50452	374 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	NDUFA8	P51970	172 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TAS2R46	P59540	309 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SHH	Q15465	462 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR51F2	Q8NH61	342 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR10G6	Q8NH81	332 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	AGR3	Q8TD06	166 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf50	Q8WW18	174 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OPALIN	Q96PE5	141 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RBBP8	Q99708	897 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RSG1	Q9BU20	258 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CALN1	Q9BXU9	219 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PXMP2	Q9NR77	195 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RGS18	Q9NS28	235 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A1W2PRD5	423 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SERPINE3	A8MV23	424 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT16	P08779	473 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ME2	P23368	584 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEA1	P43355	309 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CACNG7	P62955	275 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CYP24A1	Q07973	514 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGFL1	Q6UW32	110 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RAB1C	Q92928	201 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	HAUS1	Q96CS2	278 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	SGTB	Q96EQ0	304 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TSPOAP1	O95153	1857 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM120B	A0PK00	339 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IGHV3-11	P01762	117 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	IL4	P05112	153 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GLA	P06280	429 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GABRG2	P18507	467 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	CD70	P32970	193 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PPIC	P45877	212 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	GABRA6	Q16445	453 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	PRSS8	Q16651	343 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RPEL1	Q2QD12	228 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	WDR82	Q6UXN9	313 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM122B	Q7Z309	247 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	OSR2	Q8N2R0	312 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TTL	Q8NG68	377 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	C9orf72	Q96LT7	481 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	TMEM243	Q9BU79	118 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	ING2	Q9H160	280 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SKAP2-208	ENST00000495802	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	2.67	□□□□□ -1.98

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms