RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 MPPED2Q15777 294 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 LINC01590Q5TEZ4 76 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 C12orf54Q6X4T0 127 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 PGAP1Q75T13 922 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 DCXRQ7Z4W1 244 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 KLBQ86Z14 1044 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 BPIFB2Q8N4F0 458 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 OR2AE1Q8NHA4 323 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 JMJD8Q96S16 334 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF69Q9UC07 566 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 CD300LBA8K4G0 201 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SPI1P17947 270 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 TEX30Q5JUR7 227 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SPTSSAQ969W0 71 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 BAIAP2Q9UQB8 552 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 FAM20BO75063 409 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 RPS2P15880 293 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ENTPD1P49961 510 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 GLYATL3Q5SZD4 288 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 DRAM2Q6UX65 266 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 MIOXQ9UGB7 285 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 NUP50Q9UKX7 468 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ACOT8O14734 319 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 FAM107AO95990 144 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 CALB2P22676 271 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 CA6P23280 308 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 UBA52P62987 128 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ACTG1P63261 375 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ARMCX4Q5H9R4 360 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 LYPD2Q6UXB3 125 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 CD300LDQ6UXZ3 194 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 OR2T33Q8NG76 320 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ERGIC1Q969X5 290 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SLAMF6Q96DU3 332 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 CLPTM1LQ96KA5 538 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 REEP1Q9H902 201 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4AQ9Y536 164 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SPARCP09486 303 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 FPR2P25090 351 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 FMO3P31513 532 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF841Q6ZN19 808 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 DOK3Q7L591 496 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf87Q8N0U7 546 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf18Q8NEA5 215 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 ASB9Q96DX5 294 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 KCNJ15Q99712 375 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 LRRC30A6NM36 301 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 SLC2A1P11166 492 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PSMB10P40306 273 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 ADGRG5Q8IZF4 528 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 SPSB4Q96A44 273 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 MRI1Q9BV20 369 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 NTN4Q9HB63 628 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CMC2Q9NRP2 79 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 UFSP2Q9NUQ7 469 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PPIAL4GP0DN37 164 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PRKXP51817 358 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GNB2P62879 340 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR8G1Q15617 311 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 OR10G2Q8NGC3 310 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 RAB40AQ8WXH6 277 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 UPRTQ96BW1 309 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 FEVQ99581 238 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 COPS4Q9BT78 406 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A4Q9H015 551 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 MED20Q9H944 212 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 DHRS12A0PJE2 317 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GMDSO60547 372 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 RAP2AP10114 183 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 DCDC5Q6ZRR9 648 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS45Q7RTY3 260 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC197Q8NCU1 140 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf21Q9H246 121 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 MARCH7Q9H992 704 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-211ENST00000490677 FAM183AA6NL82 134 aa23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms