RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 C1orf94Q6P1W5 598 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LINC00471Q8N535 108 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF615Q8N8J6 731 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ACOT4Q8N9L9 421 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ABHD4Q8TB40 342 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.85□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TP53I11O14683 189 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PLPP2O43688 288 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR1F1O43749 312 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PRKXP51817 358 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 HBA1P69905 142 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TCEA2Q15560 299 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TM4SF20Q53R12 229 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GPR32P1Q8NGA4 272 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TIMP4Q99727 224 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 KLK11Q9UBX7 282 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 RNF222A6NCQ9 220 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 AK1P00568 194 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SOD3P08294 240 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 UCHL1P09936 223 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC35E2P0CK97 266 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GSTM3P21266 225 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 DLSTP36957 453 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TGM3Q08188 693 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 DUSP8Q13202 625 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 EXT1Q16394 746 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR10K2Q6IF99 312 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TMEM64Q6YI46 380 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 OR5W2Q8NH69 310 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 C3orf49Q96BT1 292 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 GPA33Q99795 319 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 TRIM2Q9C040 744 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 IL17BQ9UHF5 180 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.84□□□□□ -1.31
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PR48 441 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 GGT3PA6NGU5 568 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 IDSB3KWA1 339 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C9JQL5 133 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 OGG1O15527 345 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CDC14BO60729 498 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HTR1FP30939 366 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 AKR1C3P42330 323 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C11orf88Q6PI97 169 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RNF141Q8WVD5 230 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 HAS2Q92819 552 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TAS2R10Q9NYW0 307 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.84□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PN81 502 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF724A8MTY0 619 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CD74P04233 296 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 SFTA3P0C7M3 94 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 DCTDP32321 178 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CHRNA7P36544 502 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MAGEB1P43366 347 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MST1LQ2TV78 715 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 KHDC3LQ587J8 217 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 REEP3Q6NUK4 255 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 ZNF614Q8N883 585 aa6.83□□□□□ -1.32
USP4-211ENST00000485450 MDS2Q8NDY4 140 aa6.83□□□□□ -1.32
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