RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482582.5

TRAIP-208, Transcript of TRAF interacting protein, human

TSL 5

Gene TRAIP, Length 820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAIP-208	ENST00000482582	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582		E9PI62	339 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SULT1C4	O75897	302 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	CDK1	P06493	297 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	HTR1A	P08908	422 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF250	P15622	560 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	DCTD	P32321	178 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	TTK	P33981	857 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SERPINF1	P36955	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF92	Q03936	586 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF544	Q6NX49	715 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	STX19	Q8N4C7	294 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SGK3	Q96BR1	496 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	C4orf36	Q96KX1	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SYT3	Q9BQG1	590 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SOX7	Q9BT81	388 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SCN3B	Q9NY72	215 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582		R4GMQ9	66 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582		J3QW42	95 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	TBX1	O43435	398 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	LALBA	P00709	142 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	APOC1	P02654	83 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MT-ND2	P03891	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	KIR3DL2	P43630	455 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MMP16	P51512	607 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PSG7	Q13046	419 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	IRF3	Q14653	427 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	XAF1	Q6GPH4	301 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MUC15	Q8N387	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	MYDGF	Q969H8	173 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	CMBL	Q96DG6	245 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PGAM5	Q96HS1	289 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	LYZL4	Q96KX0	146 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	SMR3A	Q99954	134 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TRAIP-208	ENST00000482582	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	LILRA1	O75019	489 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	TTR	P02766	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	CD99	P14209	185 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	MYL12A	P19105	171 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	CDH15	P55291	814 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	ACTA2	P62736	377 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	ACTG2	P63267	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	TNK1	Q13470	666 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	WDR38	Q5JTN6	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	SPSB4	Q96A44	273 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	HAVCR1	Q96D42	359 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TRAIP-208	ENST00000482582	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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