RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 ZNRD1Q9P1U0 126 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IL19Q9UHD0 177 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ORC6Q9Y5N6 252 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 U3KQK5 164 aa5.94□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MEGF11A6BM72 1044 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DPPA5A6NC42 116 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ARRDC5A6NEK1 342 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 A6NHS1 94 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF726A6NNF4 738 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PHYHO14832 338 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ICMTO60725 284 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TOX4O94842 621 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TNFAIP8O95379 198 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GASTP01350 101 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 BGLAPP02818 100 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 THY1P04216 161 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ANXA8P13928 327 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 AHCYP23526 432 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 STOMP27105 288 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 HTR2AP28223 471 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 APLNRP35414 380 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KIR2DS4P43632 304 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PITPNBP48739 271 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TAS2R41P59536 307 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ISL1P61371 349 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PSG7Q13046 419 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 APOFQ13790 326 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC36A2Q495M3 483 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LIN52Q52LA3 116 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 RNF220Q5VTB9 566 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LAIR2Q6ISS4 152 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PGBD2Q6P3X8 592 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C11orf88Q6PI97 169 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LYPD2Q6UXB3 125 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 THAP5Q7Z6K1 395 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PXKQ7Z7A4 578 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SCAIQ8N9R8 606 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR4K5Q8NGD3 323 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR6S1Q8NH40 331 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC7A13Q8TCU3 470 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SLC38A4Q969I6 547 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 R3HDM4Q96D70 268 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 WDFY2Q96P53 400 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR8B2Q96RD0 313 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PITX2Q99697 317 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MCHR1Q99705 422 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FNDC11Q9BVV2 318 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C12orf10Q9HB07 376 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CLN8Q9UBY8 286 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 AASSQ9UDR5 926 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF232Q9UNY5 417 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IFT52Q9Y366 437 aa5.93□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1W2PRQ8 180 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PLPP3O14495 311 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 OR10H3O60404 316 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LYPD3O95274 346 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FARS2O95363 451 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 F13BP05160 661 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 LIPFP07098 398 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V1B1P15313 513 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CCNOP22674 350 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PSMB10P40306 273 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GSSP48637 474 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 BIDP55957 195 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM11AP58511 58 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1CBP62140 327 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PLP2Q04941 152 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PUDPQ08623 228 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 CD47Q08722 323 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 IL18R1Q13478 541 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 DGCR6Q14129 220 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 FAM201AQ5SY85 155 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 C5orf46Q6UWT4 87 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 ZER1Q7Z7L7 766 aa5.92□□□□□ -1.46
CASQ1-203ENST00000481081 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms