RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.5□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CIB4A0PJX0 185 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C17orf105B2RV13 164 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DISC1C4P0D8 188 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 UBDO15205 165 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TGOLN2O43493 480 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TPST1O60507 370 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ADAP1O75689 374 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TOXO94900 526 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 KDM4BO94953 1096 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 GPR75O95800 540 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CLPSP04118 112 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CD5P06127 495 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ADORA3P0DMS8 318 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SOX18P35713 384 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 IFNGR2P38484 337 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 IDH2P48735 452 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TAS2R50P59544 299 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HERV-K104P63124 156 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 IFITM3Q01628 133 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 DUSP2Q05923 314 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF616Q08AN1 781 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF763Q0D2J5 394 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PMPCAQ10713 525 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MALLQ13021 153 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 KIAA0040Q15053 153 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 XKR7Q5GH72 579 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SPINK14Q6IE38 97 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C16orf89Q6UX73 402 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SSX7Q7RTT5 188 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF546Q86UE3 836 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MFSD4AQ8N468 514 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC5A8Q8N695 610 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MORN4Q8NDC4 146 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PXT1Q8NFP0 134 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5L2Q8NGL0 311 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF721Q8TF20 911 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CFHR4Q92496 578 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC7A6Q92536 515 aa6.49□□□□□ -1.37
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RPUSD3-212ENST00000466141 LINC00052Q96N35 136 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ARV1Q9H2C2 271 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MED20Q9H944 212 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 POLE4Q9NR33 117 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HEY2Q9UBP5 337 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ANGPT4Q9Y264 503 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RAP2CQ9Y3L5 183 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.49□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 C1orf226A1L170 272 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ASPDHA6ND91 283 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 H3BN98 237 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PRRG2O14669 202 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 MRASO14807 208 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CYB5BO43169 146 aa6.48□□□□□ -1.37
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RPUSD3-212ENST00000466141 KIAA0513O60268 411 aa6.48□□□□□ -1.37
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RPUSD3-212ENST00000466141 ATP1B1P05026 303 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CHRM2P08172 466 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 IL3P08700 152 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CT62P0C5K7 136 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 RD3LP0DJH9 198 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CPMP14384 443 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 COX7A2P14406 83 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 HLA-GP17693 338 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 EGR1P18146 543 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 PTGER1P34995 402 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 TIMP3P35625 211 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 GDNFP39905 211 aa6.48□□□□□ -1.37
RPUSD3-212ENST00000466141 CD200P41217 278 aa6.48□□□□□ -1.37
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